בארכיון הציוני שמורים יותר מ-1,500 ארכיונים של אישים ממנהיגי ופעילי התנועה הציונית והיישוב. ארכיונים אלה בחלקם קטנים ביותר (תיק אחד או שניים) וחלקם גדולים מאד (עד עשרות מיכלים). רשימת בעלי הארכיונים כוללת דמויות ידועות בהיסטוריה הציונית המודרנית, כמו: תיאודור הרצל, נחום סוקולוב, דוד וולפסון, מכס בודנהיימר, הנריטה סאלד, אליעזר בן יהודה, חיים ארלוזורוב ודמויות של עסקנים, אנשי מקצוע ואחרים. התכתבויות אישיות וציבוריות, יומנים שכתבו, מכתבים משפחתיים ותמונות, שמורים בארכיונים שלהם ותורמים להבנה של דמותם ושל פועלם.
אוסף הארכיונים האישיים גדל ללא הרף במשך השנים. תחומי המחקר השתנו לאורך השנים, ובהתאם לכך התרחבו ההגדרות של הארכיון הציוני לאישים שארכיונם מתאים לשכון בין אוספי הארכיון. בתקופה האחרונה צורפו לרשימת הארכיונים האישיים ארכיונים של נשים וגברים ידועים פחות, אך לא פחות פעילים ומשפיעים בתחום התמחותם. למשל רודולפינה מנצל, שפיתחה את תחום אימון הכלבים בארץ ישראל.
האוספים החשובים וההיסטוריים הללו שמורים במחסנים תת-קרקעיים בבניין בן ששת הקומות של הארכיון הציוני בירושלים.
-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
אופן הרישום של האוספים והחטיבות השונות
א. שפת הרישום של התיקים:
תיאורי רוב התיקים בחטיבות השונות הם בעברית. אולם, אם רוב המסמכים המקוריים שבתיקי החטיבה הם באנגלית, תיאורי התיקים נרשמו באנגלית.
ב. חטיבות ותיקים:
רוב הארכיונים האישיים מסומלים באות "A" חוץ מארכיון תיאודור הרצל המסומל ב-"H1" וארכיון דוד וולפסון המסומל ב-"W1".
לדוגמא:
· ארתור רופין – A107
· אליעזר בן יהודה – A43
· לייב יפה – A13
אם הארכיון האישי הוא קטן וכולל תיק אחד או תיקים ספורים בלבד, סימולו "AK". לדוגמא:
· אוריאל אדיב - AK826
· נתן גורליק – AK685
כל ארכיון אישי מורכב מתיקים, לעיתים תיקים בודדים ולעיתים עשרות אלפי תיקים בהתאם לכמות החומר שנוצר בידי הארגון על ידי אותו איש. התיקים השייכים לחטיבה מסויימת מסומלים לפי מספר ייחודי בתוך החטיבה. לדוגמא:
ג. תעודות/פריטים מיוחדים מסוגים שונים בתיקים:
לעיתים צויינו, מתחת לרמת הרישום של כותר/תיאור התיק הכללי, תעודות מיוחדות (מכתב, פרוטוקול, דו"ח, חוברת וכו') בעלות זיקה לנושא הכללי של התיק או פריטים חריגים אחרים הן בסוג (מפה, תצלום, כרזה וכו') והן בגודל. פריטים אלה סומלו ונרשמו ברמה נפרדת מתחת לתיאור/כותר התיק הכללי.
פריטים בגודל חריג (מעל A4) שנמצאו בתיקים (תעודה, מפה, כרוז, כרזה, תצלום), הוצאו מתוכם והושמו במגירות מיחדות בהתאם לגודלם. במקרים שכאלה צורף דף רמיזה מיוחד לתיק המציין את פרטי הפריט שהוצא.